1哈尔滨商业大学,药物工程技术研究中心,哈尔滨, 150076; 2哈尔滨商业大学药学院,哈尔滨,150076; 3哈尔滨商业大学图书馆,哈尔滨,150028
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 9 篇
收稿日期: 2019年02月02日 接受日期: 2019年02月08日 发表日期: 2020年06月17日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 9 篇
收稿日期: 2019年02月02日 接受日期: 2019年02月08日 发表日期: 2020年06月17日
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摘要
肉桂酸 4- 羟化酶(cinnamate-4-hydroxylase, c4h)是合成黄酮类化合物的关键酶之一。为了研究Dlc4h基因的结构及其在龙眼次级代谢产物合成中的功能,本研究采用实时荧光定量 PCR (qRT-PCR)技术分析Dlc4h基因在龙眼根、茎、叶组织中的特异性表达,并对该基因进行了生物信息学分析。定量分析结果表明:Dlc4h基因在各组织中均有表达,表达量由高到低依次为根、茎、叶。生物信息学分析结果表明:该基因全长1 611 bp,编码 536个氨基酸;蛋白质相对分子质量为 61 389.45 Da,等电点(pI)为 8.82;它是一种不含信号肽、有跨膜结构、定位于质膜的可溶性亲水蛋白;二级结构主要包括α- 螺旋和无规则卷曲,并具有卷曲螺旋结构;采用 SWISS-MODEL构建Dlc4h三级结构模型,运用 Ramachandran评估表明该模型准确可靠;Dlc4h预测得到的配体结合位点分别为 128Arg、145Val、146Phe、153Trp、157Arg、213Met、329Ile、332Ala、333Ala、336Thr、337Thr、340Ser、402His、467Pro、468Phe、473Arg、475Cys和 476Pro。本研究的结果为进一步研究Dlc4h基因在龙眼黄酮类化合物生物合成途径中行使的功能提供依据。
关键词
龙眼(Dimocarpus longan Lour.);肉桂酸 4- 羟化酶;生物信息学分析
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